Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms