Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTBN1Q01082 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms