Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM2Q00987 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms