Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG9Q00887 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSG9Q00887 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms