Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK16Q00536 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms