Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL7P80098 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL7P80098 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL7P80098 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms