Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC5P78333 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC5P78333 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC5P78333 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC5P78333 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms