Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMC1P62191 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMC1P62191 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms