Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01547P58512 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms