Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms