Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP107P57740 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP107P57740 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP107P57740 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP107P57740 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP107P57740 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms