Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX4P57082 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX4P57082 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX4P57082 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBX4P57082 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX4P57082 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX4P57082 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX4P57082 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX4P57082 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX4P57082 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms