Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIPK4P57078 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms