Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE1P56817 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE1P56817 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE1P56817 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE1P56817 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE1P56817 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE1P56817 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE1P56817 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE1P56817 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE1P56817 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BACE1P56817 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BACE1P56817 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE1P56817 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms