Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP1P53367 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARFIP1P53367 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms