Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK4P51957 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK4P51957 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK4P51957 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK4P51957 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK4P51957 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK4P51957 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK4P51957 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK4P51957 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms