Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSEN2P49810 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms