Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT3P49368 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT3P49368 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT3P49368 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT3P49368 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT3P49368 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms