Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMTP48728 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMTP48728 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMTP48728 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMTP48728 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMTP48728 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms