Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL21P46778 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL21P46778 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL21P46778 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL21P46778 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms