Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP13P45452 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP13P45452 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP13P45452 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP13P45452 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP13P45452 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP13P45452 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP13P45452 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms