Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPD2P43304 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPD2P43304 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPD2P43304 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPD2P43304 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPD2P43304 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPD2P43304 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms