Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV4P43268 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV4P43268 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV4P43268 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms