Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGER3P43115 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms