Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms