Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YGR149WYGR149W 1299 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MRPS35YGR165W 1038 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MRPL49YJL096W 486 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MSA2YKR077W 1092 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SDO1YLR022C 753 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 ERG2YMR202W 669 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 CPR8YNR028W 927 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YBR242WYBR242W 717 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RIF1YBR275C 5751 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 POL3YDL102W 3294 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 CCM1YGR150C 2595 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YHR202WYHR202W 1809 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SNQ2YDR011W 4506 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YIG1YPL201C 1386 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 PDS1YDR113C 1122 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SCM4YGR049W 564 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YIR040CYIR040C 333 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RPS28BYLR264W 204 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 CAT5YOR125C 702 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YOR238WYOR238W 912 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 UAF30YOR295W 687 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 TIM12YBR091C 330 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 TPD3YAL016W 1908 nt3.31□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 GCD6YDR211W 2139 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 NSE3YDR288W 912 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 DAL2YIR029W 1032 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YJL175WYJL175W 513 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YLR297WYLR297W 390 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RAD10YML095C 633 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 DGA1YOR245C 1257 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 DIM1YPL266W 957 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SPO14YKR031C 5052 nt3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MGR3YMR115W 1506 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 CLG1YGL215W 1359 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 TRE2YOR256C 2430 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SHU2YDR078C 672 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 PEX10YDR265W 1014 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YIR014WYIR014W 729 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 PET130YJL023C 1044 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 DLS1YJL065C 504 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 BUR2YLR226W 1188 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SFH1YLR321C 1281 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MRPL16YBL038W 699 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RPL13BYMR142C 600 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RPL20BYOR312C 519 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MRPL37YBR268W 318 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MAL12YGR292W 1755 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MAL32YBR299W 1755 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 POL2YNL262W 6669 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 FAS1YKL182W 6156 nt3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 ACK1YDL203C 1872 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YDR089WYDR089W 2610 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 RPN1YHR027C 2982 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SSE2YBR169C 2082 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 LIF1YGL090W 1266 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MAK16YAL025C 921 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 PEX11YOL147C 711 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 HPA2YPR193C 471 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YDL180WYDL180W 1644 nt3.28□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 BUD4YJR092W 4344 nt3.28□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 ARG2YJL071W 1725 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 ERG9YHR190W 1335 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 EDC1YGL222C 528 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YLR012CYLR012C 300 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 OXR1YPL196W 822 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 SKP2YNL311C 2292 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 HEH2YDR458C 1992 nt3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 GYP6YJL044C 1377 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 EPL1YFL024C 2499 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YCL076WYCL076W 744 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 snR63snR63 255 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YDL242WYDL242W 354 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YGR107WYGR107W 450 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 GCD14YJL125C 1152 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 RPN13YLR421C 471 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 SEC14YMR079W 915 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 OCA2YNL056W 594 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YBL094CYBL094C 333 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 RPS7AYOR096W 573 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 USV1YPL230W 1176 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 snR34snR34 203 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 FRE4YNR060W 2160 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 HAP4YKL109W 1665 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 ATP25YMR098C 1839 nt3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 FLO1YAR050W 4614 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 TCP1YDR212W 1680 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 JIP5YPR169W 1479 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YIL025CYIL025C 375 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 CAB2YIL083C 1098 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 PHD1YKL043W 1101 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 SDH3YKL141W 597 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 HRT3YLR097C 1035 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 TRI1YMR233W 681 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 RPS11BYBR048W 471 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 ENA2YDR039C 3276 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 ENA1YDR040C 3276 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 RSM23YGL129C 1353 nt3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 YKR015CYKR015C 1707 nt3.24□□□□□ -1.89
SHQ1P40486 AEP2YMR282C 1743 nt3.24□□□□□ -1.89
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