Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRLP40313 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRLP40313 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms