Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 IAH1YOR126C 717 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MRPL51YPR100W 423 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SRC1YML034W 2505 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 VPS53YJL029C 2469 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YHR202WYHR202W 1809 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MSM1YGR171C 1728 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 CCT7YJL111W 1653 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 TRM12YML005W 1389 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 BUD4YJR092W 4344 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YOR365CYOR365C 2112 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YDR340WYDR340W 303 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 PEX11YOL147C 711 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 RAS1YOR101W 930 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YOR238WYOR238W 912 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SNQ2YDR011W 4506 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MAK21YDR060W 3078 nt3.01□□□□□ -1.93
DDI1P40087 RAD5YLR032W 3510 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 TRM1YDR120C 1713 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YDL071CYDL071C 375 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YDL242WYDL242W 354 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YDR355CYDR355C 303 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YDR442WYDR442W 393 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 ECM4YKR076W 1113 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 RPL13BYMR142C 600 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 GOT1YMR292W 417 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 TAF3YPL011C 1062 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 snR34snR34 203 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YHR080CYHR080C 4038 nt3□□□□□ -1.93
DDI1P40087 PCI8YIL071C 1335 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 KAP104YBR017C 2757 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YIL175WYIL175W 318 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 INN1YNL152W 1230 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SUR1YPL057C 1149 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YBR089WYBR089W 600 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 GPI13YLL031C 3054 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MSS4YDR208W 2340 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 CIN8YEL061C 3003 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 CHO2YGR157W 2610 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MET10YFR030W 3108 nt2.99□□□□□ -1.93
DDI1P40087 ATP25YMR098C 1839 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 DSS1YMR287C 2910 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SEC15YGL233W 2733 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 PEX10YDR265W 1014 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 CGR1YGL029W 363 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 BLS1YLR408C 369 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YMR310CYMR310C 954 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 EBS1YDR206W 2655 nt2.98□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MSR1YHR091C 1932 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 PBI1YPL272C 1554 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YHP1YDR451C 1062 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 SAY1YGR263C 1275 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 DOG2YHR043C 741 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 REG2YBR050C 1017 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 YSA1YBR111C 696 nt2.97□□□□□ -1.93
DDI1P40087 NDT80YHR124W 1884 nt2.96□□□□□ -1.93
DDI1P40087 ROM1YGR070W 3468 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YCR015CYCR015C 954 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPL1BYGL135W 654 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPS23AYGR118W 438 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 SAS5YOR213C 747 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPL1AYPL220W 654 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPS23BYPR132W 438 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YGR237CYGR237C 2358 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MIP6YHR015W 1980 nt2.96□□□□□ -1.94
DDI1P40087 PLM2YDR501W 1566 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 BCH1YMR237W 2175 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MRH4YGL064C 1686 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 VPS17YOR132W 1656 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 SGN1YIR001C 753 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MAK16YAL025C 921 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RSM26YJR101W 801 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MBR1YKL093W 1020 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 SEC14YMR079W 915 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 HHF1YBR009C 312 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPL20BYOR312C 519 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 HUT1YPL244C 1020 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 STT4YLR305C 5703 nt2.95□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YDR222WYDR222W 1248 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 SPT2YER161C 1002 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 IME1YJR094C 1083 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RPL22AYLR061W 366 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 HMX1YLR205C 954 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 NIT3YLR351C 876 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YLR416CYLR416C 399 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 TIF34YMR146C 1044 nt2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms