Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGCXP38435 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGCXP38435 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGCXP38435 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGCXP38435 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGCXP38435 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGCXP38435 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGCXP38435 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGCXP38435 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGCXP38435 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms