Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZEB1P37275 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZEB1P37275 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms