Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PUF6YDR496C 1971 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 GCD6YDR211W 2139 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 MSM1YGR171C 1728 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 POL31YJR006W 1464 nt2.9□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RSN1YMR266W 2862 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 MSB2YGR014W 3921 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 QCR10YHR001W-A 234 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 SDP1YIL113W 630 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YLR297WYLR297W 390 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RAS1YOR101W 930 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PMR1YGL167C 2853 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 STE6YKL209C 3873 nt2.89□□□□□ -1.95
CAF4P36130 EPL1YFL024C 2499 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 EXO70YJL085W 1872 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PRP8YHR165C 7242 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YCR007CYCR007C 720 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 AIM25YJR100C 984 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 AHP1YLR109W 531 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YLR326WYLR326W 723 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RPN13YLR421C 471 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 TUM1YOR251C 915 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 USV1YPL230W 1176 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YPR203WYPR203W 309 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 XRN1YGL173C 4587 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 SRO9YCL037C 1305 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PHO81YGR233C 3537 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 AEP2YMR282C 1743 nt2.88□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YIL169CYIL169C 2988 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RPL1BYGL135W 654 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 MRPL16YBL038W 699 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YIM2YMR151W 438 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 DDI3YNL335W 678 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YPL107WYPL107W 747 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RPL1AYPL220W 654 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RGC1YPR115W 3252 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YAT2YER024W 2772 nt2.87□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ATP25YMR098C 1839 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 DYN1YKR054C 12279 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 UBP14YBR058C 2346 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 MDV1YJL112W 2145 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YKL222CYKL222C 2118 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YHR180WYHR180W 492 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 GMH1YKR030W 822 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YLR402WYLR402W 192 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 TAF14YPL129W 735 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YPR150WYPR150W 522 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 FAA2YER015W 2235 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PAM1YDR251W 2493 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 SDS23YGL056C 1584 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 JSN1YJR091C 3276 nt2.86□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ATG13YPR185W 2217 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RKM4YDR257C 1485 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 TLG1YDR468C 675 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YGR107WYGR107W 450 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PPX1YHR201C 1194 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ARC15YIL062C 465 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 IRC18YJL037W 675 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ATP12YJL180C 978 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 SWD2YKL018W 990 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 EMG1YLR186W 759 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RPL6AYML073C 531 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RLP7YNL002C 969 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 SSN8YNL025C 972 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 LTO1YNL260C 597 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 CYC2YOR037W 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YOR082CYOR082C 342 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YBR089WYBR089W 600 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ALG8YOR067C 1734 nt2.85□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ITC1YGL133W 3795 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 RIF1YBR275C 5751 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 ERG11YHR007C 1593 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 TPD3YAL016W 1908 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 DUF1YOL087C 3351 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YDR090CYDR090C 933 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 THP2YHR167W 786 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 PBA1YLR199C 831 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 TAF3YPL011C 1062 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YPR136CYPR136C 513 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 HPA2YPR193C 471 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YBR096WYBR096W 693 nt2.84□□□□□ -1.95
CAF4P36130 YPR148CYPR148C 1308 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 TOM1YDR457W 9807 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 SRC1YML034W 2505 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 YPL216WYPL216W 3309 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 BNA4YBL098W 1383 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 FUN30YAL019W 3396 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 ECM21YBL101C 3354 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 VBA4YDR119W 2307 nt2.84□□□□□ -1.96
CAF4P36130 MOT1YPL082C 5604 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 SMC2YFR031C 3513 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 PPH3YDR075W 927 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 GRX3YDR098C 858 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 KXD1YGL079W 657 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 IME1YJR094C 1083 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 TEM1YML064C 738 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 YBL077WYBL077W 432 nt2.83□□□□□ -1.96
CAF4P36130 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.83□□□□□ -1.96
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