Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDXP35241 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RDXP35241 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RDXP35241 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDXP35241 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDXP35241 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDXP35241 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDXP35241 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDXP35241 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDXP35241 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms