Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKARP32238 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKARP32238 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKARP32238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKARP32238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKARP32238 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCKARP32238 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCKARP32238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCKARP32238 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 726.3 ms