Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms