Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXP28300 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXP28300 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXP28300 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXP28300 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXP28300 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXP28300 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXP28300 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXP28300 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXP28300 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXP28300 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXP28300 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXP28300 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms