Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB4P28070 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms