Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB9P28065 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms