Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMLP26374 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMLP26374 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMLP26374 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMLP26374 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMLP26374 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMLP26374 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMLP26374 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMLP26374 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMLP26374 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMLP26374 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms