Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTX3P26022 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTX3P26022 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTX3P26022 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTX3P26022 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms