Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms