Protein–RNA interactions for Protein: P25296

CNB1, Calcineurin subunit B, yeast

Predictions only

Length 175 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNB1	P25296	NDC80	YIL144W	2076 nt		2.63	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	CLB5	YPR120C	1308 nt		2.63	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	MDM1	YML104C	3384 nt		2.63	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	AEP2	YMR282C	1743 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	MDV1	YJL112W	2145 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YPL109C	YPL109C	1974 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	TMA17	YDL110C	453 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RAD55	YDR076W	1221 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	OTU1	YFL044C	906 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	AML1	YGR001C	747 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	AIM25	YJR100C	984 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	EBS1	YDR206W	2655 nt		2.62	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	ICR1	ICR1	3199 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	VBA4	YDR119W	2307 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RIM1	YCR028C-A	408 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YGR026W	YGR026W	837 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	SYS1	YJL004C	612 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YJL175W	YJL175W	513 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YNL057W	YNL057W	333 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	HUB1	YNR032C-A	222 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	PNT1	YOR266W	1272 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	HMS1	YOR032C	1305 nt		2.61	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YDR282C	YDR282C	1245 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	CAB2	YIL083C	1098 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YLR416C	YLR416C	399 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	MED11	YMR112C	396 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	TUM1	YOR251C	915 nt		2.6	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	AEP3	YPL005W	1821 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	SEC59	YMR013C	1560 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RTN1	YDR233C	888 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	ERG26	YGL001C	1050 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	HHF1	YBR009C	312 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.59	□□□□□ -1.99
CNB1	P25296	HAP4	YKL109W	1665 nt		2.59	□□□□□ -2
CNB1	P25296	FRT2	YAL028W	1587 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SHU2	YDR078C	672 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RPL1B	YGL135W	654 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SDP1	YIL113W	630 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RPL22A	YLR061W	366 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	REC102	YLR329W	795 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YMR084W	YMR084W	789 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RCE1	YMR274C	948 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RPL1A	YPL220W	654 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	CMK1	YFR014C	1341 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MPC54	YOR177C	1395 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	VAS1	YGR094W	3315 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SMC2	YFR031C	3513 nt		2.58	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MYO5	YMR109W	3660 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SIN4	YNL236W	2925 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MET5	YJR137C	4329 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	BSC2	YDR275W	708 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	CGR1	YGL029W	363 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YIL089W	YIL089W	618 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SWD2	YKL018W	990 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	TDA8	YAL064C-A	381 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SSN8	YNL025C	972 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RIB4	YOL143C	510 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	FLO5	YHR211W	3228 nt		2.57	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YOS1	YER074W-A	258 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RPS0A	YGR214W	759 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	IME1	YJR094C	1083 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	GLO1	YML004C	981 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	RFC3	YNL290W	1023 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	ATG29	YPL166W	642 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MGR3	YMR115W	1506 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	HRD1	YOL013C	1656 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YKR015C	YKR015C	1707 nt		2.56	□□□□□ -2
CNB1	P25296	CDC40	YDR364C	1368 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	BUD16	YEL029C	939 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YGR219W	YGR219W	342 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	PEX21	YGR239C	867 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MIP6	YHR015W	1980 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YHR080C	YHR080C	4038 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YLR365W	YLR365W	333 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MSH2	YOL090W	2895 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YPR053C	YPR053C	456 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.55	□□□□□ -2
CNB1	P25296	SPP382	YLR424W	2127 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	CTM1	YHR109W	1758 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	MSS2	YDL107W	1056 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YDR161W	YDR161W	1164 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YDR340W	YDR340W	303 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	GPP2	YER062C	753 nt		2.54	□□□□□ -2
CNB1	P25296	YGR149W	YGR149W	1299 nt		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms