Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM1P23921 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM1P23921 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM1P23921 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM1P23921 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM1P23921 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM1P23921 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM1P23921 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM1P23921 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRM1P23921 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRM1P23921 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRM1P23921 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRM1P23921 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM1P23921 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms