Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2B4P23634 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms