Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms