Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPREP23469 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPREP23469 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPREP23469 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPREP23469 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPREP23469 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms