Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KB1P23443 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms