Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX1P22670 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX1P22670 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX1P22670 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX1P22670 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms