Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDSP20132 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDSP20132 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SDSP20132 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SDSP20132 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDSP20132 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDSP20132 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDSP20132 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDSP20132 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDSP20132 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDSP20132 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDSP20132 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDSP20132 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDSP20132 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDSP20132 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSP20132 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDSP20132 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SDSP20132 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDSP20132 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms