Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR1P18146 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR1P18146 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR1P18146 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR1P18146 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms