Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF7P17544 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF7P17544 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF7P17544 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF7P17544 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF7P17544 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF7P17544 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF7P17544 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF7P17544 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms